При использовании грузоперевозок  в прямом смешанном сообщении перегрузочные работы с морских (речных) судов и складов на  железнодорожный состав и в обратном направлении осуществляются средствами порта. Соблюдение всех норм расположения и закрепления груза при погрузке и разгрузке контролируется грузоперевозчиком.

Пункты перевалки груза предназначены для перегрузки товара с железнодорожного состава на водный транспорт. Они представляют собой железнодорожные станции, порты и связывающие  их железнодорожные пути и бывают двух видов: массового пользования и специализированные (принадлежащие какой либо организации).

Порядок проведения технических перевалочных работ  между железнодорожным и портовым  транспортом регламентируется соглашением, которое заключается всеми организациями, принимающими участие в грузоперевозке. Как правило, срок действия соглашения составляет пять лет. Помимо данного документа стороны заключают дополнительные договора на использование железнодорожных путей и предоставление вагонов.

В соответствии с правилами грузоперевозок рассматриваемым способом, при необходимости технической модернизации оборудования или условий работы порта, узловое соглашение может быть скорректировано или дополнено до окончания срока его действия. Возникающие в процессе выполнения работ споры, при грузоперевозках в прямом смешанном сообщении,  решаются согласно с действующим в данной сфере законодательством Российской Федерации.

Для эффективной работы перевалочных пунктов необходимо налаженное диспетчерское управление процессами грузоперевозки, передачи груза с железнодорожного состава на суда, своевременное взаимное информирования организациями друг друга о процессе перемещения груза и сроках его доставки. Производится планирование грузовых работ, формируются графики перемещения грузов на различных видах транспорта, в зависимости от особенностей графиков работ портов и взаимодействующих с ними железнодорожных станций.

При массовых перегрузочных работах заранее оговариваются и планируются сроки подачи составов на станции и судов в порты, для своевременного проведения перевалочных работ. Как правило, в этом случае производят одновременную подачу вагонов и судов в пункты перегрузки, и применяется прямой перевалочный метод: «вагон-судно»  или наоборот.

Официальным документом передачи груза является передаточная ведомость, которая предоставляется в 4 экземплярах передающей груз стороной. Бланк  ведомости, с заполненными данными,  заверяется календарными штампами и подписями ответственных лиц передающей и принимающей стороны.

Если принимающая сторона запрашивает проверку массы груза, передающая сторона должна выполнить это требование. Если в процессе проверки выявлена недостача или повреждение груза, составляется соответствующий акт с отметкой в ведомости его номера и даты составления.

На последнем перевалочном пункте  расчет и выдача, следующего напрямую до пункта назначения, производится по судовой накладной, которая прилагается к прочим сопровождающим вагон документам.