После получения уведомления от сотрудников пограничной станции о   ввозе груза через границу, начинается таможенное оформление и досмотр груза сотрудниками таможенных служб. Уведомление о прибытии груза на передаточную станцию должно подкрепляться передаточной ведомостью и сопроводительными документами на груз.

В сроки, установленные по согласованию сотрудниками станции и таможенного контроля, осуществляется проверка груза на количество грузовых мест, сохранность опечатанных запорных устройств, целостность груза и т.д.

Таможенный досмотр автомобилей и товаров может осуществляться выборочно и сопровождается открытием упаковки, пломб запорных устройств, с целью обнаружения не указанных в накладной товаров. Подобные действия должны быть узаконены оформлением актов таможенного досмотра с последующим наложением новых пломб либо таможенной службой, либо железнодорожной пограничной станцией. Для осуществления экологического и санитарного контроля пограничные станции оборудуются специальными лабораториями.

Представитель таможенной службы производит проверку достоверности перевозочных документов, регистрирует их в соответствии с принятыми  правилами  и принимает решение о возможности ввоза товара в страну или возврата его обратно. Помимо этого груз, может быть, подвергнут дополнительной проверке или направлен в таможенный орган.

Если груз подлежит возврату, на железнодорожной накладной ставится соответствующая отметка с объяснением причин возврата. Отметка должна быть подтверждена печатью с личным номером представителя таможенного органа, производящего проверку. В случае задержания товара для дополнительной проверки, на накладной устанавливается отметка о том, что перевозка груза приостановлена. Заверяется указанная отметка аналогично предыдущему случаю. Дополнительная проверка груза должна быть проведена в минимальные сроки, и занять не более десяти дней с момента задержания.

При транспортировке товара с передаточной станции в таможенный орган, доставка груза оформляется в соответствии с действующим законодательством  данной страны. В качестве сопровождающих документов на бланке таможенной декларации, составленной в трех экземплярах и  заверенной печатью ответственного лица таможенного органа, оформляется внутренний транзитный документ. По этому документу осуществляется контроль над доставкой груза в указанные сроки в пункт назначения.

Если в результате просмотра сопровождающих груз документов, работником пограничной таможенной службы был разрешен провоз груза  через границу, два экземпляра передаточной ведомости по грузу должны быть помечены соответствующим штампом и заверены его личной печатью. После чего все документы возвращаются на пограничную станцию для продолжения транспортировки груза.

В случае если страна предоставляет для транспортировки груза транзитные железные дороги, после таможенной проверки данный груз следует по территории указанной страны под таможенным контролем.  Транзитная декларация, дорожная накладная и ведомости при этом должны быть отмечены направляющим штампом.